Nature Junior est un outil pédagogique multimédia conçu spécialement pour les curieux de nature et les passionnés de découvertes. Depuis 2009, il est développé chaque année par l’association Bourgogne-Franche-Comté Nature, en collaboration avec les rectorats des académies de Dijon et de Besançon. Le comité de rédaction de Nature Junior détermine la ligne éditoriale de la revue.
Destiné aux enseignants, aux collégiens et aux lycéens de la région, Nature Junior permet aux enseignants de présenter à leurs élèves de porter un autre regard sur la nature, à aiguiser leur réflexion scientifique et de les impliquer dans des activités ludiques sur le terrain. Il met également en valeur les initiatives locales, les acteurs du territoire et les projets réalisés en classe.