Avec pour maître mot la concertation, le plus grand réseau d’aires protégées au monde continue de faire ses preuves, sans toutefois de garantie de moyens pour son avenir.
Qu’est-ce que Natura 2000 ?
C’est un réseau comprenant des sites sur toute l’Union européenne, sur l’équivalent de près de 15 % du territoire. N’importe qui a déjà mis les pieds dans un site Natura 2000. Certains y habitent peut-être sans même le savoir. Avec Natura 2000, il ne s’agit pas de mettre sous cloche, mais d’offrir des opportunités d’actions pour préserver les espèces et les habitats pour lesquels le site a été désigné, avec un budget dédié. La démarche de classement s’appuie sur deux directives européennes, la directive Oiseaux et la directive Habitats Faune Flore. Leurs annexes listent les espèces et habitats dits « d’intérêt communautaire », dont l’état de conservation justifie cette gestion adaptée.
Comment s’organise ici la mise en œuvre de la politique Natura 2000 ?
Depuis 2023, en vertu de la loi 3DS*, la Région s’est vue confier une partie des compétences qui relevaient auparavant de l’État. Tout ce qui ne concerne ni le réglementaire, ni les contrats agricoles, revient à la Région, qui coordonne dorénavant l’animation de tous les sites de Bourgogne-Franche-Comté. 11 personnes sont mobilisées, chacune rattachée à un territoire et participant aux comités de pilotage des sites concernés. Ce sont ces comités, composés d’acteurs locaux tels que représentants d’agriculteurs, de forestiers, et élus régionaux, qui choisissent collectivement les actions à mener sur le site. Un Document d’objectifs, périodiquement révisé, structure ces décisions. Depuis sa création, le service régional Natura 2000 a renforcé les dispositifs de coopération du réseau en réunissant régulièrement tous les animateurs de sites de la région, en créant des mini-clubs départementaux d’animateurs, ou encore en développant des outils de partage plus performants.
Quelles sont les principales actualités sur la région ?
Il y a beaucoup à dire sur les 118 sites de Bourgogne-Franche-Comté. On peut notamment citer la récente expansion, en 2025, du site de la Moyenne vallée du Doubs, après un énorme travail de concertation. Fait de vallées alluviales, il s’étend à présent au-delà de Besançon, sur un secteur aux pratiques agricoles moins extensives qu’en amont. Sur les Monts de Gy, en Haute-Saône, le travail de concertation vient de démarrer, dans le but d’englober les territoires de chasse des chauves-souris dans des périmètres qui n’incluent pour l’instant que des cavités.
Christelle BOBILLIER,
Chargée de mission Natura 2000 à la Région Bourgogne-Franche-Comté
Natura 2000 est financé par la Région et l’Union européenne. La direction « Europe et rayonnement international » de la Région Bourgogne-Franche-Comté assure une importante mission pour que soient maintenus les budgets. L’association Régions de France s’est aussi emparée du sujet pour faire remonter les besoins, afin que le volet Natura 2000 ne soit pas oublié dans les futures négociations européennes. La maquette budgétaire pour les actions à venir en 2028 est en cours de définition, mais l’incertitude plane encore sur les crédits qui seront alloués. Il faut se battre à chaque fois, pour chaque période de programmation, d’autant plus dans le contexte géopolitique actuel. Natura 2000 offre pourtant de précieuses possibilités en faveur de la biodiversité tout en tenant compte des activités socio-économiques, et les progrès en termes d’acceptation locale sont remarquables après des années d’effort de terrain. Certains territoires initialement hostiles à l’idée d’un classement sont d’ailleurs désormais demandeurs.
Mini-glossaire
Loi 3DS : loi relative à la différenciation, la décentralisation, la déconcentration et la simplification.
